Le cadre du CIR continue d’évoluer en 2025–2026, dans le prolongement de ces orientations. Plusieurs modifications sont envisagées pour 2026 afin de poursuivre le soutien à l’innovation tout en contrôlant son efficience. 

Réinstauration probable d’un bonus « Jeune docteur » aménagé (dès 2026) – Le Gouvernement a proposé de remplacer l’ancien dispositif par un surcroît de 130 % des dépenses de personnel docteur sur deux ans (portant ainsi le taux effectif à 230 % au lieu de 200 %). Concrètement, une embauche de docteur ouvrirait droit à un crédit de 30 % × 2.3 = 69 % du salaire (au lieu de 30 % × 2 = 60 % précédemment). Ce nouveau bonus, moins généreux qu’avant, viserait à continuer d’encourager l’embauche de docteurs tout en réduisant légèrement l’avantage par rapport au dispositif expiré en 2025. 

Crédit d’impôt « innovation » spécial IA – Face à l’essor de l’intelligence artificielle et à ses coûts d’infrastructure, des députés ont voté un amendement pour introduire un nouveau crédit d’impôt en faveur de l’IA. Il permettrait d’inclure les dépenses en capacités de calcul haute performance (achats de processeurs GPU/CPU dédiés au calcul scientifique) dans l’assiette du CIR ou d’un crédit parallèle. Cette mesure, encore à affiner, traduit la volonté d’élargir le soutien fiscal aux investissements matériels stratégiques nécessaires à la R&D en IA. Si elle est adoptée, les entreprises pourraient bénéficier d’un crédit de 20 % (sous forme d’un CII spécifique) sur l’acquisition de certains serveurs de calculs et ressources cloud pour l’IA, ce qui n’était pas possible jusqu’ici (le CIR ne portant que sur des dépenses de R&D opérationnelles). 

Mesures anti-délocalisation – Le législateur s’est penché sur des amendements visant à conditionner le CIR : il était proposé d’exclure du bénéfice du crédit les entreprises qui ferment des sites de R&D en France pour les transférer à l’étranger, ou de les obliger à rembourser le CIR perçu les années précédentes en cas de délocalisation massive. Bien que votées en première lecture, ces mesures ont été rejetées dans la version actuelle du PLF (elles soulevaient des difficultés juridiques et pourraient contrevenir au droit européen). A priori, elles ne figureront pas dans la loi définitive. Néanmoins, le message est clair : le Gouvernement surveille l’usage du CIR et souhaite s’assurer que ce soutien profite à l’emploi scientifique en France. A minima, on peut s’attendre à un renforcement du reporting et du suivi des retombées (par exemple via l’annexe 2069-A-1 obligatoire au-delà de 10 M€ de dépenses, qui exige de détailler le nombre de chercheurs et docteurs financés). 

Extension du CICo – Par ailleurs, il est prévu de prolonger jusqu’en 2028 le Crédit d’Impôt Collaboration (CICo) qui devait expirer fin 2025. Ce crédit connexe, instauré récemment, incite les projets de recherche collaborative public-privé (30 % des dépenses confiées à des laboratoires publics, plafonné à 6 M€). Son prolongement s’inscrit dans la stratégie de soutien à l’innovation ouverte et aux partenariats entre entreprises et organismes de recherche. De même, le CII « collections » (crédit d’impôt innovation pour les dépenses de prototype dans certains secteurs créatifs) serait prorogé jusqu’en 2028, tout comme l’exonération JEI (jeune entreprise innovante) sur les impôts locaux.